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艾伦·雷普莉在诺斯特罗莫号的最后一次航行中担任飞行官。当一种未知的外星生命体附着在一名船员身上时，她试图遵循隔离协议——但她的努力是徒劳的，因为船上的“老妈”AI有其他计划。

不隔离，灾难就不可避免了。异形以船上的执行官为宿主，从他的胸口冲出，逃进了诺斯特罗莫号的内部。随着它的生长，它的恐怖一发不可收拾，捕杀船员，直到只剩下雷普莉。 

孤军奋战，希望渺茫的雷普莉救下了猫猫琼斯，并想办法在诺斯特罗莫号上设置了自毁装置，却没有意识到异形先她一步。

逃生舱分离后，诺斯特罗莫号的小光点爆炸成一个不断扩大的橙色火球。逃生舱摇晃起来，嘎嘎作响，诺斯特罗莫号消失得无影无踪，一片寂静。

解开安全带，雷普利开始准备返回的长途旅行，突然间，舱体深处的阴影中出现了一些东西——异形。 

雷普莉小心翼翼的缓步走向更衣柜，在那里穿上太空服。然后，当异形向她逼近时，她打开气闸，将异形喷射到寒冷的太空中。

一切安全后，雷普莉完成了她对商业拖运飞船诺斯特罗莫号的最终报告，然后进入了她的休眠舱。睡意的黑雾在她围绕着她，让她感到沉重和疲倦。 她在一场噩梦中睡去……却在另一场噩梦中醒来。